Hacia 1720 empezó una actividad misionera en las montañas de los andaquíes del colegio de propaganda fide de Popayán, en territorio aparentemente teoricamente payanés. Sin embargo, por lo menos a partir de la década de 1760, se estableció la misión de La Ceja como punto de partida para las entradas al interior La Ceja está en el valle de Suaza, resguardo indígena dentro de la jurisdicción de Timaná. Las “misiones de andaquíes” como territorio en todo caso se definen por su posición entre Timaná y Mocoa, otra misión del mismo colegio, pero cuyo punto de partida fue la ciudad de Pasto. Las dos vertientes misioneras confluían en la desembocadura del Orteguaza en el Putumayo. El pueblo de San Francisco Solano, ubicado en este punto, tantas veces aparece entre las misiones de Mocoa como entre las andaquíes. En lo civil, luego de 1772 se establecieron jueces y corregidores competentes para los pueblos de misión, dependientes de Timaná y el gobierno de Neiva. Para esto, véase Andaquíes (Jurisdicción).