La alcaldía mayor de Zuñi en algunas ocasiones fue unida a la de La Laguna. Hay evidencia de un alcalde mayor que nombró a su hermano como teniente en Zuñi en 1754, y dice que había heredado el título de su padre ¹⁾ - por lo que podría pensarse que esta situación ya existió por algún tiempo. Es probable que se trate del hijo de Juan Miguel Álvarez del Castillo, quien fue alcalde mayor de ambos partidos ya en 1741 ²⁾. También, en 1805 se reporta José Manuel Aragón como alcalde mayor de “Laguna, Acoma y Zuñi” ³⁾. El censo de 1790 también tiene un padrón común, pero menciona dos “jurisdicciones” aparte (y no una unida como en el caso de Santa Cruz y Taos). Aún así, a principios del siglo XVIII hubo los alcaldes mayoresJosé Naranjo en 1702 ⁴⁾ y Felipe Antonio Cisneros en 1706 ⁵⁾, y también en 1741 ⁶⁾. En tiempos de Bernardo Miera y Pacheco, en 1776, hubo un alcalde mayor propio de Zuñi, Pedro Cisneros ⁷⁾, y en 1809 se menciona un tal Joaquín Pino ⁸⁾. Es decir que la situación cambió varias veces.