Los indios cuna se mantenían como independientes de las instituciones coloniales del Imperio durante toda la Colonia. En cuanto a la pertenencia teórica a una provincia, la evidencia no es conclusiva. La parte al oeste del río Atrato en todo caso perteneció a la provincia del Darién, pero la parte oriental hasta el “río San Juan” a veces se muestra o menciona como parte de la provincia de Cartagena, otras veces como parte de la misma provincia del Darién ¹⁾ y un mapa del “Reyno Tierra Firme ú Castilla del Oro. Panamá, Veragua, Darien , Biruquete” por Juan López de 1785)). En ese último mapa, la desembocadura también es del Chocó, cortando así la provincia del Darién. El “Mapa general del Nuevo Reino de Granada formado … De orden del … Virrey D. José Ezpeleta” ²⁾, en cambio tiene la desembocadura del Atrato como parte del Chocó y la costa al oriente como parte de Cartagena. También el gobernador del Darién en un informe de 1774 presenta esta versión (AGN-C, CACIQUES_INDIOS,1,D.13, f. 183). Por lo menos a partir en 1782, la vigilancia militar de la costa y la fundación de fortines y poblaciones recayó en la comandancia de Cartagena, incluso en la parte occidental del golfo hacia Portobelo. Hubo inspectores para tal tarea nombrados por el gobernador - sin que por esto el territorio necesariamente formase parte de la provincia de Cartagena. La cartografía nacional en la tradición de Codazzi, sin embargo, muestra la parte oriental del golfo de Urabá como perteneciente a Antioquia - provincia que más tarde se apoderaría de la zona. Esta interpretación no se apoya en la cartografía de la época. En fin, la “provincia de Cunacuna” como a veces se llama en los documentos fue un area totalmente fuera del control colonial y sin concepción administrativo-territorial clara.