El corregimiento de Zipaquira fue de provisión durante todo el siglo XVIII hasta la independencia, por lo que prácticamente se convirtió en provincia propria, como se expresa en varios documentos de la época. Parece que el grado de autonomía fuemás grande en las décadas de 1770 y 1780, porque después se suele mencionar como corregimiento de Santa Fe otra vez. Figuran aparte en el informe del virrey Flores (AGN-Colombia, Colonia, Historia Civil,16, f. 263), y en la visita de Moreno Escandón, leemos una opinión del arzobispo de Santa Fe, quien puntualiza: “Mas esto no ha sucedido así en quanto a los provistos por V.M.: pues siendo el corregimiento de Zipaquirá de la jurisdicción de Santa Fe solo por veneración a aquella provisión se mira y tiene como absolutamente independiente. L lo mismo que sucede con el de Sogamoso y Duitama que siendo de la inmediazión y jurisdicción de la ciudad de Tunja caveza de la provincia y del corregidor de ella ni éste ni las justicias pueden administrarla en el territorio de aquellos dos corregimientos que no comprehenden cavildo alguno solo porque el corregidor está provehido por V.M.” ¹⁾. También en las listas de empleos políticos del virreinato que cada provincia debía entregar entre 1783 y 1790, esos dos corregimientos no figuran entre los de Tunja o Santa Fe, sino que reportaron por separado (AGI,Santa_Fe,561). También ²⁾ menciona su independencia en 1789, pero sin embargo describe los distritos dentro de Tunja y Santa Fe, respectivamente.