Este nivel reconstruye los territorios correspondientes a las diócesis coloniales. Dentro de esos territorios puede haber habido también áreas de misiones “no sujetas a mitra”, es decir fuera de la jurisdicción episcopal, inmediata a las diferentes órdenes religiosas que las mantuvieron. Sin embargo, hemos decidido no excluir esas áreas del territorio diocesano por definición porque la cura de alma de la población hispana (existente o teórica) en la zona sí podía ser sujeta a jurisdicción diocesana y en el proceso de integración de las misiones en el sistema colonial, se intgraron a la jurisdicción del obispado en cuyo territorio cayeron.